I Отделение: Планетарной геофизики и геодинамики

Заведующий отделением академик А.О. Глико

II Отделение: Разведочной геофизики и прикладной геодинамики

Заведующий отделением – д.ф.-м.н., проф. Ю.О. Кузьмин.

III Отделение: Природных, природно-техногенных катастроф и сейсмичности Земли

Заведующий отделением – член-корреспондент РАН Г.А. Соболев.

IV Отделение: Геоэлектромагнитных полей и межгеосферных взаимодействий

Заведующий отделением – д.ф.-м.н., профессор М.Б. Гохберг.

V Отделение: Математической геофизики и геоинформатики

Заведующий отделением – академик А.Д. Гвишиани.

VI Отделение: Гравиинерциальных исследований

Заведующий отделением – Заместитель директора ИФЗ РАН по научной работе д.т.н, проф. В.Н. Конешов.

VII Отделение: Координационно-прогностический центр ИФЗ РАН

Заведующий отделением – заместитель директора ИФЗ РАН по научной работе д.г.-м.н, проф. Е.А. Рогожин.